Ретрит лаборатории им. Ф.Г.Добржанского в октябре 2016

7 Октябрь 2016

Лаборатория «Центр геномной биоинформатики им Ф.Г.Добржанского» ежегодно проводит расширенные сессии, на которых сотрудники лаборатории и приглашенные участники рассказывают о своей работе, обмениваются идеями и мнениями. Такие семинары, проводимые обычно дважды в год получили название РЕТРИТ (от анг. retreat).

В этом году участниками ретрита были представители ректората университета, в том числе проректор по науке С.В.Аплонов, первый проректор И.А.Дементьев, а также директор научного парка СПбГУ С.В.Микушев и директор биобанка А.С.Глотов.
Таким образом ретрит стал развернутым представлением для ректората проекта “Российские геномы” и его основных исполнителей. С учетом ограниченности времени представителей ректората презентации были краткими, но содержательными.

Программа семинара-ретрит

Theodosius Dobzhansky Center for Genome Bioinformatics
St. Petersburg State University

9:00AM-1:00PM October 6

  • I. Intro, Goals and collecting specimens
    • S.O’Brien Introduction Goals and datasets
    • V.Brukhin Genome Russia samples
  • II. Lab protocols+ tracking
    • Anna Gorbunova Lab protocols for specimen processing
    • A.Logachov/A.Shevchenko /I.Evsyukov
  • III. Data and IT organization
    • N.Cherkasov IT capacity and needs
    • S.Simonov Websites
    • V.Rotkevich Databases
  • IV. Sequencing production and Platform Bake Off
    • D.Polev Peterhof sequencing to date
    • A.Yurchenko Bake-off description , analysis, findings
  • V. Analysis for Gene mutation discovery -new and known
    • A.Komissarov Overview of analytical findings
    • S.Kliver QC of sequence and SNV calls
    • S.Sidorov Multi sample alignment and SNV calls
    • K.Krasheninnikova Copy number variation
    • G.Tamazian Known mutations
    • D.Zhernakova Novel mutations
  • VI. Natural History
    • P.Dobrynin Population and demographic analysis
  • VII. Phenotypes
    • A.Shevchenko GWATCH gene association Application
    • S.Malov Statistics & mutations
    • Katya Chernyaeva TB Russia
  • VII. Closing
    • S.OBrien Summation

2016-10-06-11-04-42-1